吞咽困难最常见于消化道疾病，尤其是食管癌，然而它不仅仅局限于食管癌。下面简单的阐述吞咽困难的鉴别诊断。
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食管癌是发生于食管上皮的恶性肿瘤，食管癌最常见的症状就是吞咽困难，早期食管癌表现为进食哽咽感，随着病变的进展出现进行性吞咽困难，这也是食管癌最典型的症状。
食管癌钡餐下主要表现为黏膜局限性增粗、管壁僵硬、充盈缺损或龛影等表现。
内镜为首选检查，内镜下可直视病变，估计腔内受累的范围，并可得到组织学确诊。
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成人型嗜酸性粒细胞食管炎（EOE）最常见的临床表现是吞食固体食物后吞咽困难。
EOE 是一种以食管功能障碍为主要临床表现、食管上皮嗜酸性粒细胞浸润为主要病理特点的疾病，其诊断标准为至少有 1 个活检组织中每高倍视野不少于 15 个嗜酸性粒细胞（嗜酸性粒细胞食管炎患者中嗜酸性粒细胞可不均匀浸润食管上段）。
嗜酸性粒细胞食管炎的内镜下特点为：固定环（同行环、波状食管、波状环）、渗出（白色点状或斑块）、沟纹（垂直线、纵向沟纹）、纸样黏膜，狭窄等。
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贲门失弛缓症主要表现为间断性吞咽困难，是一种动力障碍性疾病，表现为吞咽后食管不蠕动和食管下括约肌不能完全松弛。一般认为该病属于神经源性疾病。
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贲门癌是指发生在胃贲门部的恶性肿瘤，主要临床表现为胸骨后或上腹部疼痛、异物感、反流、恶心、呕吐、吞咽困难等，贲门癌应注意和食管下段癌区分。
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胃食管反流病是指胃十二指肠内容物反流入食管引起反酸等症状和（或）并发症的疾病。其典型症状为反酸和烧心，并有胸骨后疼痛、吞咽困难、咳嗽、咽部不适等表现，病程较长。
内镜为首选检查，内镜下表现为黏膜充血水肿、糜烂或溃疡，并根据食管黏膜破损的范围和形状分为 A、B、C、D 四级。
24 小时动态食管 PH 检测为诊断的金标准，但不作为首选。
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食管良性肿瘤主要表现为胸骨后饱胀、疼痛压迫感和轻度吞咽梗阻感。食管良性肿瘤最常见的为食管平滑肌瘤，其次还有黏膜下层的息肉、脂肪瘤、纤维脂肪瘤、乳头状瘤、血管瘤等。临床症状一般轻微。
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食管憩室是指食管壁的一层或全层局限性膨出，形成与食管腔相同的囊袋。早期憩室很小可无症状，随着憩室增大，患者出现咽部异物感、食物停滞感、反流、呛咳等症状。若憩室内有食物潴留，可引起颈部压迫感。巨大憩室可逐渐引起食管狭窄，出现吞咽困难。
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食管良性狭窄是指由于食管先天发育异常、炎症、瘢痕、良性肿瘤、外压、运动障碍等原因引起的食管管腔狭窄或食物通过困难，以进食后哽噎或吞咽困难为主要表现的一组病症。食管狭窄的病因及程度的诊断主要依靠 X 线钡餐检查、内镜检查及食管动力检查。
内镜检查：可确定狭窄性质，即炎性狭窄或癌性狭窄以及病变部位。
X 线钡餐检查：有助于确定有无机械性或动力性梗阻, 显示腔内梗阻或腔外压迫以及食管病变的特征, 是临床最为常用的重要的检查方法。
食管测压: 对动力性吞咽困难是一种重要的检查手段，能清楚地显示吞咽困难的动力障碍的特点。
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食管在其走行过程中经过和跨越许多结构和器官。其附近结构和器官的病变可以机械地影响食管，造成外压，严重时可导致吞咽困难；如纵隔肿瘤、纵隔脓肿、食管周围淋巴结肿大、胸骨后甲状腺肿、左心房明显增大、主动脉瘤等。
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此外还有一些其他系统疾病或全身性疾病可引起吞咽困难，如脑血管意外、肌萎缩性侧索硬化、脑干肿瘤、帕金森病、重症肌无力、多发性肌炎、代谢性肌病、系统性红斑狼疮、硬皮病等。因此吞咽困难还需与上述疾病鉴别。
本文仅供医学药学专业人士阅读
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